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規(guī)格:/Twist 新一代測序 (NGS) 甲基化檢測系統(tǒng)提供了可靠、端到端的樣本制備解決方案,用于鑒定人類基因組中的甲基化區(qū)域。該工作流采用了 New England Biolabs? 獨特的酶法工藝,對 DNA 的損傷小得多,并采用了 Twist 的定制甲基化組合設(shè)計。
無論您是研究細(xì)胞分化還是篩查癌癥的液體活檢,該系統(tǒng)都能提供極有效的甲基化檢測。
主要優(yōu)勢
端對端解決方案
? 先進(jìn)的非甲基化胞嘧啶酶轉(zhuǎn)化
? 使用高性能定制 Twist 探針進(jìn)行均一捕獲
? 使用優(yōu)化試劑提高了中靶率
創(chuàng)新的文庫制備
? 更高的文庫復(fù)雜性和更好的 GC 平衡,獲得更好的結(jié)果
? 比亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化多檢測 15% 的 CpG
? 樣本損傷更少,支持更低的樣本起始量
? 輕松地將工作流程放到現(xiàn)有的甲基化測序流程中
優(yōu)化的雜交試劑
? 在不影響性能的情況下調(diào)整雜交時間
? 使用甲基化促進(jìn)劑提高了中靶率
? 雜交時間少于 4 小時
高效定制組合*
? 精密的設(shè)計,準(zhǔn)確的合成和精細(xì)的質(zhì)量控制,能*大限度地提高捕獲的均一性和重現(xiàn)性
? 同時捕獲正義鏈、反義鏈、甲基化和未甲基化 DNA
? 擁有各種組合大小、靶標(biāo)區(qū)域和多重分析需要的卓越性能
? 輕松添加或增強(qiáng)組合內(nèi)容
NEBNext? EM-seq? 試劑盒,用于 Twist 靶向甲基化測序
Twist Bioscience 與 New England Biolabs (NEB) 合作,提供新的甲基化測序工作流程,可提高文庫質(zhì)量,無需在文庫制備過程中處理破壞性重亞硫酸氫鹽。
該工作流程包括未甲基化胞嘧啶的酶轉(zhuǎn)化(見圖),以確定甲基胞嘧啶 (5mC) 和羥甲基胞嘧啶 (5hmC) 的位點。
酶轉(zhuǎn)化產(chǎn)生更完整、更具代表性的文庫,并*終實現(xiàn)更靈敏的甲基化檢測。文庫制備系統(tǒng)適用于使用 Twist 甲基化組合進(jìn)行全基因組測序和下游富集。
EM 測序轉(zhuǎn)化包括一系列酶促步驟,將未甲基化的胞嘧啶轉(zhuǎn)化為尿嘧啶。*終結(jié)果與常規(guī)亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化相同,從而使 EM 測序與使用 Bismark 和 bwa-meth 的現(xiàn)有分析流程兼容。
Twist 快速雜交系統(tǒng)和自定義甲基化組合
Twist 快速雜交和洗脫試劑盒提供更優(yōu)的性能和極大的靈活性??蓪υ噭┖筒襟E進(jìn)行優(yōu)化,以調(diào)整下游測序指標(biāo),并減少手動操作時間,減少移液器的使用。
Twist 定制甲基化組合采用高度精密的算法設(shè)計,對不同大小的靶標(biāo)有著卓越的捕獲效率。這些組分共同確保了對定制目標(biāo)區(qū)域的*佳雜交捕獲。
Twist 甲基化促進(jìn)劑
在靶向甲基化測序工作流程中經(jīng)常發(fā)生脫靶捕獲,因為在文庫制備時,轉(zhuǎn)化過程降低了樣本的復(fù)雜度。
為了*大限度地捕獲轉(zhuǎn)化后樣本,Twist 新一代測序 (NGS) 甲基化檢測系統(tǒng)采用專為甲基化檢測設(shè)計的專有阻斷劑。這種試劑稱為甲基化促進(jìn)劑,可減少多達(dá)一半的脫靶捕獲。
差異甲基化區(qū)域的高靈敏度檢測
甲基化水平在整個人類基因組中差異很大,因此可使用差異甲基化區(qū)域 (DMR) 來鑒定某些癌癥。
為了測試甲基化水平對 Twist 新一代測序 (NGS) 甲基化檢測系統(tǒng)性能的影響,通過以限定比率結(jié)合低甲基化和高甲基化基因組 DNA,生成不同甲基化水平(0–**** 甲基化)的文庫。該分析顯示甲基化水平對*終測序指標(biāo)的影響極小。
Twist 新一代測序 (NGS) 甲基化檢測系統(tǒng)還能以高靈敏度捕獲低甲基化和高甲基化區(qū)域。
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