文庫構建概念
DNA文庫構建是二代測序技術的基礎,其目的是將待測定樣本的大片段基因組DNA片段化為小片段的DNA,之后在小片段DNA分子兩端添加測序接頭,形成能上機測序的有效文庫的過程。文庫構建,*終是將待測的DNA或RNA樣本轉化為適合測序的文庫。
文庫構建流程
1.打斷及末修: 將DNA或RNA打斷為適合測序平臺的片段大小并修復末端損傷
2.加接頭:在片段兩端加上特定的接頭序列
3.DNA純化:去除文庫中的雜質,提高文庫質量
4.文庫擴增:通過PCR擴增文庫,增加文庫的產(chǎn)量
5.文庫質檢:評估文庫的質量,包括文庫的濃度、片段大小分布、純度以及是否存在污染等,以確保文庫符合測序要求
文庫構建方法
DNA建庫方法是分子生物學的實驗原理,其本質就是在待測片段兩端加上接頭的過程,由于NGS測序的應用廣泛,不同應用方向的文庫制備流程仍有較大差異,目前建庫方法包括以下四種。
1. 物理/酶切打斷建庫
通過物理或酶切打斷基因組DNA,然后通過連接酶將接頭連接到DNA片段上,*后通過PCR擴增。這種方法可以有效保留樣本的幾乎所有基因組信息,適用于全基因組測序。包括TA連接接頭建庫、平末端連接接頭建庫、Swift法建庫!
2. 轉座酶建庫
轉座酶法建庫技術的關鍵是Tn5轉座子,Tn5轉座子是一種細菌轉座子,本質是一段含有若干抗性基因和編輯轉座酶基因的DNA片段。轉座酶建庫利用Tn5轉座子將DNA片段化、末端修復、接頭連接等多步反應轉變?yōu)橐徊椒磻?,大大縮短了建庫時間。起始量低至1ng,適用于珍貴的樣本或低核酸含量的樣本。
3. 雜交捕獲建庫
雜交捕獲根據(jù)核酸分子堿基互補配對原則,針對目標區(qū)域設計特異探針,打斷基因組DNA,加上測序接頭后與探針雜交,將基因組DNA目標區(qū)域捕獲下來,回收目標DNA片段即可。
4. PCR擴增子建庫
擴增子建庫是指利用PCR反應在待測DNA片段兩端加上接頭的方法,原理相對比較簡單,只需要兩輪PCR和兩步純化就可以得到目標區(qū)域的文庫,**步是含通用序列的引物與目標區(qū)域結合,第二步通過PCR反應連接測序接頭,使得構建的文庫可以用于上機測序。
杭州麥伯生物技術有限公司長期致力于NGS產(chǎn)品的研發(fā)和生產(chǎn),針對illumina及華大平臺,麥伯推出高通量測序上游樣本文庫制備試劑盒,本文為大家推薦多款高質量的NGS建庫試劑盒,供您選擇!
麥伯產(chǎn)品信息
產(chǎn)品名稱 | 貨號 | 規(guī)格 |
MagicSeq Tn5 DNA Library Prep Kit for Illumina(for 1ng DNA) | M3111/M3112 | 24次/96次 |
MagicSeq Tn5 Transposase | M3131/M3132 | 100ul/500ul |
MagicSeq Tn5 DNA Library Prep Kit for Illumina(for 50ng DNA) | M3141/M3142 | 24次/96次 |
MagicSeq DNA Library Prep Kit for Illumina | M3151/M3152 | 24次/96次 |
MagicSeq DNA Library Prep Plus Kit for Illumina | M3161/M3162 | 24次/96次 |
MagicSeq DNA Library Prep Kit for MGI | M3191/M3192 | 24次/96次 |
MagicSeq DNA Library Prep Plus Kit for MGI | M3201/M3202 | 24次/96次 |
Magic UDI Adapters for illumina | M321 | 96次 |
MagicSeq Small RNA Library Prep Kit for Illumina | M3221/M3222 | 24次/96次 |
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